本发明属于人工合成基因领域，具体涉及一种脂肪酶基因COLIP及其编码的脂肪酶、表达脂肪酶基因COLIP的基因工程菌。本发明公开了一种脂肪酶基因COLIP，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，由其编码的脂肪酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。与现有技术相比，本发明所获得的脂肪酶基因COLIP可在毕赤酵母中超高效表达，所构建的毕赤酵母基因工程菌GS115（COLIP）可以用来大量生产脂肪酶。发酵结果显示：在10 L发酵罐条件下，发酵120小时，发酵液中脂肪酶的酶活可稳定在45,000 U/mL以上，发酵液中蛋白含量稳定在3.2 g/L以上。