本发明公开了一种高山被孢霉发酵滤液饮料的制备方法，包括：发酵滤液的获取；对获取的发酵滤液依次进行灭菌、过滤和脱色预处理，提取预处理后发酵滤液的上清液作为基液；将植脂末、浓缩奶粉、速溶红茶粉和稳定剂进行干混处理并加入热水中溶解，调配获得原液；将提取的基液与调配的原液进行混合调配，获得奶茶饮料，并对获得的奶茶饮料依次进行乳化、均质、杀菌、冷却和灌装处理。本发明提供的高山被孢霉发酵滤液饮料的制备方法：工艺简单、配比适宜，制得的奶茶饮料口感细腻、醇厚香滑，不但可以节约资源，保护环境，为微生物在油脂研发的横向研究上提供了新的思路，在工业化生产的道路上具有很高的可行性和极大的经济效益。