本发明公开了一种多功能水果挑选包装机，包括用于根据水果尺寸来进行挑选的挑选装置、用于切割保鲜纸并将其包裹于挑选出的水果外的保鲜纸包装装置、用于将包裹有保鲜纸的水果进行发泡网包装的发泡网包装装置，以及用于将包裹有保鲜纸或发泡网的水果装入果箱的自动装箱堆码装置。本发明进一步提出一种多功能水果挑选包装机的包装方法。本发明提出的多功能水果挑选包装机，通过设置挑选装置、保鲜纸包装装置、发泡网包装装置以及自动装箱堆码装置，实现了从水果的挑选、保鲜纸的包装、发泡网的包装以及最后装箱的一整套工艺流程，减少了人工的工作量，提高了工作效率。