本发明公开了一种水酶法同时制备文冠果油和文冠果蛋白的方法，包括：步骤一、浆液获取；步骤二、加入多糖复合酶酶解，得到一次文冠果油；步骤三、一次破乳，得到二次文冠果油；步骤四、二次破乳，得到三次文冠果油，并与一次文冠果油和二次文冠果油混匀，得到文冠果油；步骤五、一次碱提；步骤六、二次碱提；步骤七、酸沉，得到文冠果蛋白。本发明提供的水酶法同时制备文冠果油和文冠果蛋白的方法，工艺简单安全，提取的文冠果油香味更浓，颜色浅，质量好；制得的文冠果蛋白纯度更高，蛋白质含量高于50%，可作为一种良好的功能性配料广泛应用于食品加工中。